Responsables :
S. BOSCHI-MULLER
I. MOTORINE
S. RAHUEL-CLERMONT
Notre objectif principal est d’établir des relations structure-fonction détaillées pour les enzymes et les protéines apparentées d’intérêt biomédical et/ou biotechnologique, dans le but non seulement de comprendre les processus biologiques fondamentaux, mais aussi de manipuler l’activité enzymatique à des fins spécifiques.
Les recherches de l’équipe sont menées dans deux domaines principaux : les mécanismes moléculaires de signalisation et régulation cellulaire médiée par le peroxyde d’hydrogène (H2O2) et le sulfure d’hydrogène (H2S), dont la spécificité dépend de la chimie redox du soufre, essentiels dans de nombreux processus physiopathologiques (axe SRE : P.I. S. Boschi-Muller et S. Rahuel-Clermont) et les mégaenzymes appelées polykétides synthases (PKS) qui participent à la biosynthèse dans les bactéries et les champignons de métabolites secondaires de grande valeur clinique (axe PKS : P.I. K.J. Weissman). Notre recherche s’appuie sur un ensemble de compétences en enzymologie moléculaire et techniques biophysiques, incluant le génie protéique et génétique, les cinétiques enzymatiques classique et rapide (stopped flow, quench flow), les spectroscopies de fluorescence et de dichroïsme circulaire, la spectrométrie de masse, la cristallographie aux rayons X, le SAXS, la RMN et les techniques de caractérisation des interactions biomoléculaires in vitro (ITC et SPR) et in cellulo (BiFC).
Les objectifs de l’axe SRE sont centrés sur des mécanismes moléculaires associés à différents processus physiopathologiques et impliquant des protéines et enzymes qui dépendent de la chimie complexe du soufre. Ces dernières participent à des processus biologiques essentiels incluant le métabolisme, la détoxication, la signalisation et la régulation cellulaire redox via les espèces réactives de l’oxygène (comme les peroxydes) et le sulfure d’hydrogène (H2S). Les projets se concentrent sur deux thèmes principaux :
Le dénominateur commun à ces mécanismes est l’implication de la chimie redox de la cystéine (thiolate, disulfure, persulfure, polysulfures, acides sulféniques et sulfiniques, et thiosulfinate). Nos activités de recherche s’appuient sur une expertise reconnue en enzymologie moléculaire, cinétiques rapides et classiques et techniques spectroscopiques et biophysiques (S. Boschi-Muller, S. Rahuel-Clermont, F. Talfournier), ainsi que de notre expertise en spectrométrie de masse en conditions dénaturantes et natives (H. Mazon) et récemment en biochimie cellulaire redox (B. Selles). Nous développons des collaborations avec des groupes de recherche experts en biologie redox, biophysique, approches sur molécules uniques, biologie structurale et chimie théorique.
Des modifications chimiques introduites à une étape post-transcriptionnelle (Post-Transcriptional Modifications – PTM) sont présentes dans pratiquement tous les types d’ARN cellulaires. Ces PTM sont connues notamment pour moduler la stabilité des ARN et les interactions ARN-protéines. Le développement récent de technologies de séquençage à haut-débit rend possible l’analyse des PTM dans des espèces d’ARN de faible abondance. Nous cartographions des PTM (2′-O-methylations, méthylations des bases, pseudouridines) dans des ARNm et des ARNnc dont les ARN ribosomiques (ARNr), les snoRNA et les lncRNAs et nous étudions le rôle fonctionnel de ces PTM. En particulier, nous étudions l’impact des PTM dans les ARNm, les ARN de transfert et les ARNr sur l’efficacité et la fidélité de la traduction des ARNm.
Collaborations au sein de l’Université de Lorraine : C. Paris (ENSAIA, UL), B. Aigle/P. Leblond (DynaMic, INRA/UL), F. Favier/G. Mulliert (CRM2, CNRS/UL), A. Beaussart (LIEC, CNRS/UL), F. Martin (IAM, INRA/UL)
Collaborations Nationales : C. Cambillau/S. Spinelli/A. Goulet (AFMB, CNRS/Université Aix-Marseille) ; A.Van Dorsselaer/S. Cianferani (LSMBO, CNRS/Université de Strasbourg) ; M. Tolédano (CEA Saclay) ; I. André (INSA Toulouse) ; J. M. Lancelin (CNRS, Université de Lyon) ; V. Lattard (VetagroSup, Lyon)
Collaborations Internationales : A. Kirsching (Université d’Hannovre, Allemagne) ; R. Cox (Université d’Hannovre, Allemagne) ; A. Tavassoli (Université de Southampton, Royaume-Uni) ; P.F. Leadlay (Université de Cambridge, Royaume-Uni) ; Isomerase Therapeutics (Cambridge, Royaume-Uni) ; J. F. Collet (Université catholique de Louvain, Belgique) ; V. Vasiliou (Université du Colorado, Etats-Unis) ; V. I. Muronetz (Université d’État Lomonossov – Moscou, Russie) ; O. Ventura (Université de la République – Montevideo, Uruguay) ; G. van Wezel/A. Briegel (Université de Leyde, Pays-Bas)
Notre action est soutenue par différents organismes, dont l’ANR, la région Grand Est, l’Université de Lorraine (Université d’Excellence), la Ligue Contre le Cancer, le PEPS/Mirabelle, SAYENS, FEDER (FRCR 3BR).
Doctorant, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
Professeure, Université de LorraineProjets Biographie Bureau : BiopôleContacts |
Technicienne de Reherche, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
IE, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
Assistante ingénieure, Université de LorraineProjets Biographie Bureau : BiopôleContacts |
Doctorant, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
Maître de Conférences, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
 | Professeur, Université de LorraineProjets : Développement de techniques à haut-débit pour l’étude des nucléotides modifiés Biographie :
Bureau : Biopôle 1F08Contacts |
Ingénieur de Recherche, CNRSProjets : Biographie :
Bureau : BiopôleContacts |
Asistant Ingénieur, Université de LorraineProjets Biographie Bureau : BiopôleContacts |
DR, CNRSProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
Maître de Conférences, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContact |
Maître de Conférences, ULProjets Biographie Bureau : BiopôleContacts |